国家工程实验室各理事单位在能力整合、优化技术体系架构基础上，以海洋水下设备试验与检测技术研究为载体，以科研项目为纽带，完善和丰富技术合作、转移、辐射与服务，建立面向全球、服务于行业的协同创新机制。目前，已建立《国家工程实验室章程》及《国家工程实验室科研项目管理办法（暂行）》等7项管理办法，为国家工程实验室顺利运行提供制度保障。